Dégâts et symptômes
Phomopsis sclerotioides est responsable de taches gris-noir soulignées d'une ligne foncée sur les racines des cucurbitacées. Les lésions sont légèrement concaves et se forment principalement autour du point d’attache des racines latérales et des poils racinaires. Les lésions peuvent s’élargir et encercler la racine. Les racines prennent une couleur brun jaunâtre à noire et finissent par dépérir. Des lésions noires avec corps fructifères apparaissent le plus souvent quand la température atteint environ 20 °C alors qu’à 10 °C les lésions sont brun clair. Les lésions peuvent être cernées par des pseudostromata, c’est-à-dire un tissu de couleur foncé qui ressemble à des stries noires.
En général, la maladie se limite à quelques racines mais dans les cas les plus graves toutes les racines peuvent être infectées. Au stade final de la maladie, seul subsiste le tissu vasculaire car le cortex (la couche externe) a pourri. En début de culture, l'infection entraîne un retard de croissance, des feuilles plus petites d’un vert intense. Elle peut tuer les jeunes plants dans les cas les plus graves. Si l'infection est moins grave, le flétrissement des plantes se produit à un stade ultérieur, mais peut aussi survenir plus tôt dans la saison si l’arrosage n’a pas été suffisant, par exemple durant les périodes de forte évaporation. Dans les plantes qui flétrissent, la partie aérienne prend un aspect imbibé d’eau, devenant brun clair et s’affaissant avant de prendre une teinte noire et exsudant des spores de couleur ambre. Au tout début du flétrissement, il est difficile de faire la distinction avec les autres symptômes de flétrissement.
Le champignon peut aussi provoquer la pourriture noire des fruits.